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微生物ゲノムのシーケンス解析

 

1.単離された微生物のゲノム​解析

  • MiSeq、PacBio及びNanopore技術で得られた微生物ゲノムシーケンスのアセンブリを行います

  • 微生物ゲノムシーケンスのアノテーションを行います

  • シーケンスのビニング技術で単離培養中の優占菌のゲノムシーケンス解析を行います

​参考論文:

Okubo T et al. (Wang Y is the 12th among total 48 coauthors) (2012) Complete genomic structure of Bradyrhizobium sp. S23321: insights into symbiosis evolution in soil oligotrophs. Microbes Environ. 27, 306-315.

2.メタゲノムのシーケンス解析

  • メタゲノムシーケンスの生物相を解明します

  • メタゲノムシーケンスのビニング技術を用いて優占菌種のゲノムを抽出します

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